港珠澳大桥是由国务院批准建造的。

2003年8月，国务院批准开展了港珠澳大桥项目前期工作，并同意成立由香港特区政府作为召集人，粤港澳三方组成的“港珠澳大桥前期工作协调小组”，2004年3月，港珠澳大桥前期工作协调小组办公室成立，全面启动港珠澳大桥各项建设前期工作。2006年12月，经国务院批准，成立了由国家发改委牵头的“港珠澳大桥专责小组”，负责项目前期工作中重大问题的协调。

港珠澳大桥建造超级工程总设计师是孟凡超。2004年初，孟凡超开始主持港珠澳大桥的可行性研究，于2009年12月完成港珠澳大桥主体工程的初步设计。2011年2月至2012年10月，孟凡超又主持完成了港珠澳大桥深水区桥梁工程施工图设计。港珠澳设计、建设的近15年时间，孟凡超全程参与其中。港珠澳大桥岛隧工程项目总经理兼总工程师是林鸣。